С 2002 года факультет биологии и экологии осуществляет сотрудничество в рамках Программы "Балтийский университет" (ПБУ). 

Программа представляет собой в 1991 году совместный образовательный проект, направленный на решение проблем:

Охраны окружающей среды;

Устойчивого развития и демократических  і дэмакратычных преобразований в регионе путем проведения образовательных инициатив;

Укрепления роли университетов в обществе.

Участниками сети является более 200 университетов из 14-ти стран Балтийского региона (Финляндия, Эстония, Латвия, Литва, Россия, Беларусь, Польша, Германия, Дания, Швеция, Украина, Норвегия, Словацкая Республика, Чешская Республика).